Le Lac de Grand-Lieu, à cause de son caractère exceptionnel, relève de plusieurs zonages réglementaires particuliers.
Il s’agit de sites ou « monuments naturels dont la conservation ou la préservation présente au point de vue artistique, scientifique, légendaire ou pittoresque, un intérêt général ».
Aux zonages réglementaires, s’ajoutent les zones d’inventaires, sans portée réglementaire :
Egalement, le lac de Grand-Lieu étant un plan d’eau de plus de 1000 ha, il est soumis à l’application de la loi « littoral ».